故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。 动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。
演员：花江夏树 鬼头明里 下野纮 松冈祯丞 冈本信彦 上田丽奈 大塚芳忠 浪川大辅 樱井孝宏 早见沙织 日野聪 小西克幸 花泽香菜 河西健吾 杉田智和 铃村健一 关智一 森川智之 悠木碧 井泽诗织 小泽亚李 花守由美里 关俊彦 绿川光 子安武人 丰崎爱生 木村良平 福山润 小松未可子 坂本真绫 山下大辉 诹访部顺一 平川大辅 楠大典 保志总一朗 植田佳奈 内山昂辉 大桥贤一郎 稻田彻 小清水亚美 森久保祥太郎 白石凉子 伊藤加奈惠 桑谷夏子 立花慎之介 三木真一郎 桑岛法子 佐藤聪美 大地叶 本渡枫 小原好美
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